No pudo compararlo con Xoops y Joomla porque estos últimos no los he provado... mi experiencia con SPIP fue breve, de pura curiosidad. Me gustó

.
No recuerdo haber tenido algún problema para la instalación... ¿introdujiste bien los datos?, ¿creaste previamente tu BD para SPIP?.
http://www.spip.net/es_article80.html
Para personalizar debes saber de HTML y CSS y saber manejar los bucles propios de SPIP (una de sus "desventajas"; se usa mucho Frances), sabiendo eso no es más que crear los "esqueletos" (plantillas).