Estás confundiendo un poco las cosas, NO hay ninguna limitación para que desde tu aplicación puedas conectarte a cualquier base de datos, a lo que probablemente se refiera el texto, es que sólo se puede trabajar localmente con las herramientas de base de datos de este
IDE, cosa que no tiene nada que ver con tu aplicación...
Puedes ver una comparativa de las distintas versiones del vs.net para que tengas una idea:
http://msdn.microsoft.com/vstudio/products/compare/
Saludos