Hola! Una forma que se me ocurre de "encriptar" es haciendolo en Flash. así no ven el código ni los enlaces...
También se puede esconder el código en un archivo JS (esto suponiendo que el que vaya a ver el código sea neofito en la materia) o en JS que llamen a otros JS que llamen a otro... pero eso da igual. Es lo que dice Chacal, si lo quieren ver... lo verán. Porque incluso hay formas de ver el código protegida con las tag´s secretas de su hermandad... ;). Ahora en serio, la forma más sencilla que se me ocurre es lo del flash.
Salu2
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