Cita: ¿Se puede deber a que intento codificar archivos NTSC al sistema PAL?
Probablemente se debe a eso
Utiliza otro programa para la codificación, como el TMPGEnc o el DVD#VCD. Este último te lo recomiendo pq puede pasarte los archivos NTSC a PAL, sin saltos de imagen.
www.mundodivx.com/mpeg/dvd2mpg.php 