Ah, entiendo.
Aquí tienes algunas instrucciones básicas:
http://kb.textdrive.com/article/pass...ng-directories (inglés)
Y aquí puedes descargar un manual completo sobre Webmin:
http://www.informit.com/content/down...408828_pdf.zip (inglés)
Ten en cuenta que en el archivo httpd.conf debes permitir ".htaccess overriding".
Y siempre puedes hacerlo manualmente. Aquí tienes algunas instrucciones acerca de cómo hacerlo:
http://www.freewebmasterhelp.com/tutorials/htaccess/3 (inglés)
http://www.javascriptkit.com/howto/htaccess3.shtml (inglés)
Saludos,