Hola:
Si quieres modificar las opciones tienes que crear objetos Option...
elSelect[elIndice] = new Option(elTexto, suValue);
Y si quieres activar una opción ya existente (sería más lógico)... puedes hacer directamente una asignación al select:
elSelect.value = elValor; // hay algo en las FAQs.
Saludos
