He usado varias veces el procedimiento indicado y no he tenido problemas. Esa advertencia aparece siempre que se modifica algo relacionado con las particiones, pero no deberías asustarte por ello.
De todas formas,
siempre que estés haciendo cambios tan relevantes en tu sistema, debes respaldar; nunca se sabe si justo en ese momento se produce algún problema. ¿Supongo que ya respaldaste toda tu información importante, verdad?
