No he entendido tu pregunta a la perfección pero te voy a responder a lo que he entendido.
He entendido que tienes 2 particiones: 1 para documentos y la otra para el SO.
Si formateas la del SO, la otra particion te queda intacta (lo la has formateado).
Para acceder a esa unidad tienes muchar formas : por MS-Dos. por Windows 9x, Me, 2000, Xp, linux ...
Espeo q te sirva de algo
