Humm, podrias pasarlo a fireworks y luego de fireworks a flash...
De todos modos, el mejor formato para trabajar con transparencias es el .png (png24) de esta forma te guarda la transparencia.
Nota: el formato .png te subira bastante el tamaño de tu imagen. Es preferible que la transparencia la hagas en el mismo flash modificando el valor _alpha de la imagen...
ArgoN
