Me parece que el problema es que estás trabajando al revés .. por qué mejor no generás el archivo en HTML y de ahí lo exportás a PDF ???
Podrías también exportarlo a Flash Paper, que es un nuevo formato que está promoviendo Macromedia. para ver estos archivos, sólo necesitas FlashPlayer.
Un dato interesante, es que el programa generador de FlashPlayer también te permite exportar a PDF y el costo de la aplicación es muchísimo menor que el de Adobe Acrobat.
Pasar de HTML a texto es una cuestión de Copy & Paste
