Código PHP:
$adm_files=mysql_query("select idfile,TBUsuario_id_user,nombre_file,tipo_file,peso_file,com_file,DATE_FORMAT(fecha_file, '%D %M %Y') as fecha_file,publicado_por
from tbarchivo
where publicado_por='$value[id_user]' order by idfile desc")or die(mysql_error());
Cuando usas date_format en mysql le cambia el nombre al campo, por eso puse "as fecha_file" para que renombre como querías