Deberias dar de alta solo el index principal (la pagina donde te da a elegir el idioma deseas).
Luego yo te aconsejo que consigas que otros sitios web enlacen a la pagina de inicio de cada uno de los idiomas del sitio.
Si es posible consigue enlaces desde sitios en distintos idiomas que enlacen a la correspondiente seccion de tu sitio.
Tambien te aconsejo que coloques descripciones en los tres idiomas en la pagina principal, no que solo esten los enlaces.
Tambien, algo que puede no tener mucho valor, pero llegado el caso tal vez te ayude, es utilizar <p lang="idioma">parrafo</p>
para cuando escribes parrafos de cada idioma en el index principal de tu dominio.
Saludos.