Basicamente lo que tienes que hacer es que la aplicación, en vez de ser un JFrame o un JWindow, o el contenedor que hayas utilizado, utilice un JApplet. Prueba a crear un applet, que seguro que el JBuilder tiene algun tipo de asistente para hacerlo e incluye los mismos componentes que añadiste a tu aplicación (y el codigo, claro

).
Suerte!
Zerjillo