Hola
En la PC, solamente debe estar un solo disco duro.
Es decir solo debe estar el DD configurado por jumpers como Master.
Despues de que el DD haya iniciado y cargado el SO y reiniciado la PC, entonces ya puedes apagar y poner el segundo DD, pero como esclavo. No te olvides de poner los Jumpers en la posición de esclavo.
No es conveniente ni correcto poner dos DD para recien iniciar la PC e instalarle el SO.
1) Retira un DD
2) El DD que queda instalado debe estar con los jumpers en "master"
Que te vaya bien.