Si, puedes elabora los documentos PDF directamente desde PHP, para lo hay hay varios scripts disponibles, algunos gratuitos y sólamente es cuestion de buscar en internet.
Otra alternativa es elaborar directamente los PDF desde Flash. Para esto deberás descargar el componente BlazePDF.
http://www.blazepdf.com/download.html
La única limitante del programa es que no puedes exportar al PDF los elementos gráficos que hayas hecho en modo de diseño, sólamente los textos y gráficos que hayas realizado en tiempo de ejecución con AS.
Si como dices únicamente requieres elaborar reportes y/o tablas entonces esto funcionará bien para tus necesidades.
Saludos.