Hola otra vez:
¿Y si entrecomillas el contenido del include...

?
¿Has visto el resultado en tu explorador...

?
Acabo de probar un fichero sencillito y va muy bien:
Código:
<html>
<body onload="document.getElementById('temporal').style.color = 'blue'">
<? include "rojo.inc"; ?>
</body>
</html>
Y rojo.inc contiene esto:
Código:
<div id=temporal style="color:red">
rojo
</div>
Saludos