Según la estructura que creaste para el segundo disco, Xp se confunde, porque las dos particiones son PRIMARIAS, se supone que en cualquier disco duro, sólo la primera partición puede ser primaria, las siguientes tienen que ser "unidades lógicas en partición extendida". Cámbia ese valor con partition magic, ó elimina y vuelve a crear esas particiones.
Por lo de cilindro 1024, ya he visto eso antes, es por el hecho de que creaste una partición primaria en el lugar donde debe existir una extendida. Corrige eso.
Bye...