Puedes solucionar tu problema colocando scrolling="yes" o scrolling="auto" dentro de tu frameset. Aqui tienes un ejemplo:
Código HTML:
<frameset rows="202*,196*" cols="*" framespacing="0" frameborder="NO" border="0">
<frame src="topfrm.html" name="topFrame" frameborder="NO" scrolling="YES|AUTO" noresize marginwidth="0" marginheight="0">
<frame src="mainfrm.html" name="mainFrame" frameborder="NO" scrolling="auto" noresize marginwidth="98" marginheight="0">
</frameset>