Deberías haber eliminado GRUB del MBR antes de eliminar la partición de SuSE...
- Una posible solución sería arrancar el modo de recuperación de Windows desde el CD de instalación y ejecutar el comando fdisk /MBR
- Otra solución sería volver a instalar SuSE, cuando termines, otra vez te saldrá el menú de GRUB al arrancar, arrancar Windows y ejecutar el comando fdisk /MBR para posteriormente volver a borrar la partición de SuSE.
Sé que la solución más "limpia" es la primera, pero como no estoy seguro de que funcione (ni siquiera sé la versión de Windows que utilizas, el 98 no tenía modo de recuperación...), pues te propongo también la segunda como alternativa.
Saludos.