Saludos amigo Lachero
Me gusta tu firma
Asumo que estás usando alguna versión de Linux
Es generalmente normal que Linux tome algo de memoria extra y va guardando buffers que luego van siendo liberados, lo que si veo sospechoso son los siguientes números:
Server load 0.45 Alto para solo dos dominios, yo tengo los mismos server loads en máquinas que alojan cientos.
Swap Used - 0.01 % significa que ha estado corta de ram fisica y ha comenzado a usar el disco
usa el comando top a ver que procesos estan consumiendo la mayor cantidad de ram, un mal ajuste en php, httpd, o algun proceso sin control podría ser el responsable. tambien te sugiero desactivar todo proceso que esta activo y no uses.
Cualquier cosa estoy a la orden
Atentamente
Guillermo Calvo