Los necesita para que PHP los meta en un Array.
Lo que tiene que hacer es lo siguiente
Código HTML:
<form name="form1" method="post" action="">
<input type="checkbox" name="sel[]" id="sel_0" value="1" onclick="document.getElementById('sel_1').checked = 'checked';" />
<input type="checkbox" name="sel[]" id="sel_1" value="1" onclick="document.getElementById('sel_0').checked = 'checked';" />
</form> -codigo no testeado.