Son lo mismo, porque hacen referencia al sistema operativo que en el caso de windows (de versión Me y NT en adelante), está en segundo plano.
Las Siglas MS-DOS significan "MicroSoft-Disk Operating System"
Ó si lo mencionas en su modo corto DOS, verás que es lo mismo.
"MicroSoft-Sistema Operativo de Disco"
Bye...