Para quitar ese menú, desde windows, ejecuta
FDISK /MBR
Y para aprobechar el espacio del disco utilizado por linux, lo tendrás que formatear, por ejemplo, con
partition magic.
Si no tienes dinero o no quieres usarlo en comprar
partition magic (aunque creo que hay una demo gratis, pero no sé de qué manera estará limitada...), puedes utilizar
qtparted desde una
knoppix.
Saludos.