Puedes probar con DVD2AVI:
www.mundodivx.com/dvdavi/dvd2avi.php
Si te fijas, este programa te permite marcar qué trozo quieres sacar, con la barrita inferior que tiene, asi que eso es lo que tienes que hacer...
El AVI es un formato muy extendido y lo podrás convertir luego al formato que quieras sin problemas
Un saludo