Y no sería más fácil que tu funcion Javascript reciba los parámetros y formes la cadena desde tu funcion..y en vez de usar un hyperlink coloques un templatecolumn y uses un simple "<a href.." ?
ejemplo
Cita: function miFuncion(dato1, dato2)
{
var url = 'frmConsultaBitacora.aspx?COD_UNICOM=' +
dato1 + '&ciclo=' +
dato2';
var w=window.open(url,'mw','width=425,height=400,resiz able=yes, scrollbars = yes')'
}
....
...
<ItemTemplate>
<a href="javascript
:void()" onclick="
mifuncion('<%# Container.DataItem("COD_UNICOM")%>','<%# Container.DataItem("CICLO") %>')">algun texto</a>
</ItemTemplate>
Espero que te sirva.. cualquier cosa por aqui andamos..
Salu2