Estás utilizando un disco de inicio para esos comandos supongo verdad? Bueno supongo que si, pero si no es asi, de cualquier modo te recomiendo q consigas uno de win 98 o win me. Los puedes descargar de aquí:
http://www.suryweb.com.ar/programas/down23.htm
Luego reinicias tu pc (con el disco de inicio adentro del floppy), configuras el setup para que realice el booteo desde la unidad de diskette, y cuando llegues al ms-dos, ahi tecleas los comandos q te dieron. (recuerda q fdisk sirve para crear y eliminar particiones, y format para formatear)