Existe una aplicación llamada net2ftp que puedes subir a tu servidor y desde ahí conectarte al ftp y hacer todo lo que quieras
La ventaja es que no necesitas mas que un navegador, no es necesario que tengas un programa ftp instalado en el ordenata. Te dejo la web donde tienes hasta una demo:
http://www.net2ftp.com/index.php?language=es
Saludos
