Hola:
La verdad es que la he visitado y no encuentro un motivo lógico para que no funcione...
Para que veas que la forma que te he comentado va bien hice este ejemplillo:
Código:
<html>
<body>
<a href="prueba.html" target="popup" onclick="window.open('', 'popup', '')">prueba</a>
</body>
</html>
Qhe puedes hacerlo correr en mi probador de script (así solo copias y pegas):
http://www.pepemolina.com/probador/index.html
y podrás ver el resultado...
Por cierto, si pones la DTD estricta no va a validar con el target a no ser que lo asignes con un script... onclick='this.target = "NydusW";...'
Otra cosa... si la ventana principal se llamase NydusW, tampoco se abriría un popup.
Saludos