La verdad yo no se, pero tuve el mismo problema, ahora no uso movieclips, todo lo hago sobre el layer raiz, porque aparte el preloader no carga mis movie clips asi que al llegar a cada uno de ellos la animacion se ponia mas lenta.
Espero que puedan ayudarnos jajajaj
<marquee behavior="alternate" direction="up">Carlos Clark</marquee>