Hola:
Viendo el poco código que has puesto, creo que tu problema está en como nombras al formulario... tendrías que hacerlo colgar al menos del objeto document... incluso creo que es aún mejor usar la colección de formularios (document.form)
Lo de poner atrás o adelante no puede ser la razón, así que pon la página como tu la puedas entender mejor.
Código:
<script language="JavaScript" type="text/JavaScript">
function crear() {
document.forms.cedula_per.retorno.value= "si";
document.forms.cedula_per.uno.value= "uno";
document.forms.cedula_per.submit()
}
</script>
Saludos
