Problemas en internet pero no en intranet

[Dynk]

Buenas,
Veamos, lo que puedes mirar son las excepciones que te lanza el servidor (Visor de sucesos).
Ahi puedes mirar si la aplicación te puede estar fallando.
También podrias mirar si la aplicación tiene acciones pesadas que por LAN sean rapidas pero por Internet sean tan pesadas que se colapse tu ancho de banda.
Otra cosa que podrias hacer es tirarle una prueba de estres a la aplicación para intentar averiguar sus fallos.