Reinicias tu pc, de modo que booteé con el diskette de arranque de win 98. Una vez en la pantalla de ms-dos, cambias la unidad a: por la de tu unidad de cd, (si es la d, entonces tecleas d: y enter). Luego le das dir para ver si el instalador viene en ingles o en español, (instalar.exe o setup.exe) puede ser que tengas que teclear "cd win98" sin las comillas y enter, en fin, busca entre los directorios el instalador, lo tecleas (setup y enter) o (instalar y enter) y listo.. con eso comenzará la instalación.
Por cierto, te recomiendo que copies las cabs a la unidad c: para que cuando se le quiera instalar algo nuevo no tengas que estar introduciendo el disco de windows 98, las cabs vienen precisamente en un directorio llamado "win98".