Cita: primero me indicas que actualize el foro de la forma habitual (subir los archivos respetando el orden de los directorios, también subir los directorios contrib e install y ejecutar desde el navegador el archivo update_to_latest.php)
Eso sí, lo primero. Luego para el mod ya es otra cosa... Es como si tuvieras que volver a instalarlo, pues tienes que volver a modificar todos los archivos de nuevo. Pero si lo haces así, no tienes que hacer la parte de la instalación que corresponde a la base de datos, pq eso ya lo tienes, y así en principio no pierdes nada de lo que ya tuvieras subido
Aunque como mencionas que vas a actualizar también el mod, no sé si te puede dar algún problema... Yo lo que haría sería instalar de nuevo la misma versión que tuvieras de antes, comprobar que todo funcione, y luego seguir los pasos para actualizarla