En realidad es por una cuestión de accesabilidad. Si un usuario pide incrementar el tamaño de las fuentes es porque no las puede llegar a leer. Si no las lee, no sirve de nada que el diseño se mantenga exacto y colocadito pues no puede llegar a acceder a su contenido (no lo ve)
El hecho de que explorer no reaccione al cambiar el tamaño de las fuentes establecidas en pixels es a causa de un bug. El resto de navegadores sí respetan esta accesabilidad