Si tiene algunas utilidades, ahora mismo se me ocurren dos:
* Instalar un script. En lugar de tener que descomprimirlo en tu PC y subir vía FTP miles de ficheritos, subes el .tar.gz, entras vía SSH y lo descomprimes.
* Hacer backups o restaurar bases de datos. Aunque todos los paneles de control lo permiten, a veces fallan si la base de datos es muy grande. Se puede entrar vía SSH y usar mysql o mysqldump directamente desde consola.
Pero hay que saber un poco de Linux a nivel de consola...