Me parece q cuando entras a la página de
Windows Update te aparecen dos opciones: rápida y personalizada. Si le das en personalizada te mostrará cuales son las actualizaciones que te faltan y tú podrás elegir la que deseas que se instale.
En esa misma pagina a la derecha viene un cuadro que dice como está configurado tu equipo para recibir las actualizaciones. Puedes darle click ahi donde dice: elija el momento en que desea recibir actualizaciones y configurar el horario, el modo, etc. en q se descargarán.