Ese tipo de ventanas, se abren con el evento Javascript window.open dentro del código HTML, un ejemplo sería:
Código HTML:
window.open('ventana.html','ventana','width=300, menubar, resizable, height=500, top=70, left=200, scrollbars,toolbar,location');
Como ves, el primer parámetro es el link donde se encuentra el documento HTML a cargar, el segundo, el nombre que le queremos dar a la ventana, y después tenemos parámetros para personalizar la ventana, como por ejemplo el ancho y alto de la ventana, la distancia a la izquierda y superior de aparación de la misma, si la queremos con barra de estados, barra de herramientas, con barras de desplazamiento....
Espero haberte ayudado