La primera pasada analiza la peli para ver dónde hay más movimiento y por tanto dar más bitrate, y donde hay menos y por tando dar menos bitrate... eso lo que hace es aumentar la calidad del archivo final. Y sí sirve, pues mientras se codifica la segunda pasada, se va mirando los datos obtenidos durante la primera

(que es un archivo de mucho menor tamaño que una película normal)
Yo siempre recomiendo codificar a dos pasadas, que aunque tarde el doble, la calidad final merece la pena