Solo basta con que hagas ésto:
System.Diagnostics.Process.Start("tu_archivo.exe")
Ahora que si quieres mas detalles de lo que vas a hacer, puedes crear un objeto ProcessStartInfo
Algo así:
Cita: System.Diagnostics.ProcessStartInfo psi = new System.Diagnostics.ProcessStartInfo("tu_archivo.ex e");
psi.UseShellExecute = false;
psi.RedirectStandardOutput = true;
psi.RedirectStandardInput = true;
....
....
System.Diagnostics.Process proc = System.Diagnostics.Process.Start(psi);
Salu2