que curiosa tu necesidad.
podrias hacer un temporizador en la B que cada 2 o 3 segundos compruebe un valor de la ventana A, como por ejemplo el contenido del body. si este valor no existe pues eso quiere decir que la ventana A tampoco existe.
aunque la verdad que cuando el temporizador vaya a comprobar el contenido del body de la ventana A, como este no existe dara error. pero entonces capturas el error de la ventana B. por lo que cuando se produzca este error, eso querra decir que la ventana A no existe.
nunca he probado de hacer esto, pero creo que si puiede funcionar.
crees que podras con ello? o te pongo algo de codigo.
P.D. ahora no te he puesto nada de codigo porque no lo tengo, tendra que hacerlo de 0.