¡¡¡¡¡YA ESTAAA!!!!
¡¡Era por el formato de audio!! Los vídeos que me pasaron tendrían un formato de audio extraño y por eso me lo hacía mal. He probado de exportar el .mov a otro .mov con una codificación de audio distinta y ahora lo hace ESTUPENDAMENTEEE.
La verdad es que de sonido no entiendo mucho pero os indico lo que he puesto por si alguien se encuentra con el mismo problema y de esta forma se le arregla:
formato: Entero (Big Endian)
Frecuencia de muetsreo: 32,000 kHz
Tamaño de la muestra: 16 bits
Canales:mono