Una cosa q he probado
si pongo en el html
<asp:TemplateColumn HeaderText="Pagado Todo">
<ItemTemplate>
<input id="micheck" type="checkbox" onclick='javascript
:add( "<%# (Container.Dataitem ("id")).toString %>" ) ;' checked=false />
</ItemTemplate>
</asp:TemplateColumn>
el false tb entre comillas,da igual y salen todos cehekadossera por lo q me comentaste de q si solo aparece ya el checked lo toam como true cdo no esta el runat="server"
Como podria hacer para solucionar esto??