Que tal PaulaAM, antes que nada bienvenida
Cita: ¿Donde puedo almacenar el valor que devuelve el return?
El return lo devuelves desde javascript...,

obviamente cando haces un confirm, te regresa un booleno para indicar si haces o no el postback... ya cuando afirmas se ejecuta el evento que lo mando a llamar..
De todas formas si gustas explicate un poco mas para que necesitas saber el valor.. si ya estás dando por hecho que si el usuario selecciono "aceptar" y regresas un "return true" es porque deseas ejecutar tu método del lado del server.
SAlu2