Prueba con Pinnacle Studio Plus. Yo tuve un problema similar al capturar con Movie Maker, y con Adobe Premiere el sonido sale con algo de ruido... El Pinnacle es el que mejor resultado me ha dado.
En cuanto al formato de captura, hazlo como AVI DV, así no pierdes calidad, y luego lo pasas a MPG o lo que quieras después de editarlo...
También puede ser que tengas mal los codec. Instálate el DV Codec de
www.mainconcept.com a ver si mejora.
Saludos