Creo que tienes una pequeña confusión de conceptos. Te recomiendo que leas el siguiente tema:
http://www.forosdelweb.com/f19/faq-dominios-hosting-122182/
Primero tienes que asegurarte que tu nombre de dominio ya tenga asignados los DNS de tu proveedor. Esto lo puedes hacer consultando tu dominio en cualquier herramienta Whois, como por ejemplo:
http://www.internic.com/whois.html
Si todo lo demás ya está "configurado", entonces con tu herramienta FTP (como el WS_FTP que mencionas) simplemente accedes vía FTP al servidor web, poniendo en los campos respectivos el nombre del dominio, el nombre de usuario FTP y la contraseña de ese usuario, datos que seguramente te habrá suministrado tu proveedor.
Inténtalo.
Saludos,