Gracias por sus respuestas, lo que me resulto fue lo del archivo hosts, pero no poniendole en todas las pcs ya que me llevaría bastante tiempo, lo que hice fue ponerlo en el archivo hosts del linux (/etc/hosts), y habilite en el squid que me lea este archivo, probe y funciono correctamente, lo unico que hice fue poner el siguiente registro.
192.168.0.x
www.empresa.com empresa
Y funciono......
