Además de poner lo del "wmode" sólo resta poner al menú desplegable un z-index mayor que cero o meter el swf en una capa con z-index menor que cero.
la prueba de que se puede hacer está en esta web:
http://www.intermonoxfam.org/page.asp?id=1&idioma=1
Lo del "wmode" funciona en los siguientes navegadores (el comportamiento de z-index no lo he comprobado más que en el IE 6)
Internet Explorer 3 o superior (Windows)
Internet Explorer 5.1* y 5.2* (Macintosh)
Netscape 7.0*
Mozilla 1.0 o superior*
AOL*
CompuServe*
* Para esta función es obligatorio disponer de Macromedia Flash Player versión 6,0,65,0 (Windows) o 6,0,67,0 (Macintosh) o una versión superior.
(fuente:
http://www.macromedia.com/es/support...ents/wmode.htm)
Saludos