Recuerdo que ya se ha tratado en otro thread el comportamiento :hover vs IE.
Y es que IE sólo lo interpreta dentro de etiquetas <a> o sea, links.
Particularmente no he encontrado al respecto una solución en CSS pero en html lo he solucionado así.
<tr onMouseover="this.bgColor='#CC00FF'" onMouseout="this.bgColor='#660066'">
Lo tedioso de esta práctica es que cada <tr> necesita esta línea de código. Espero el hilo permanezca abierto en fin de encontrar una buena solución.
Saludos.