Puedes crear una funcion javascript de ésta forma:
Cita: <head>
<script language="JavaScript">
function closeApp() {
var w = window.self;
w.opener = window.self;
w.close();
}
</script>
Y desde tu codebhind la mandas a llamar...
Cita: Response.Write("<script>closeApp();</script>")
Espero que te sirva.
Salu2