Raro, tienes buena memoria RAM...
Usas Win XP?? -consume muchos recursos y deja poco al usuario.
Qué reproductor?? -Si es alguno raro, habría que probar con otros.
Video compartido o de tarjeta gráfica?? -Si usas video compartido, seguro es un martirio el desempeño del compu.
Me inclino a pensar en algo de la memoria RAM, sucede a veces, la primera vez que cargas un archivo grande se reproduce lento, se carga en RAM y a la segunda corre sin problemas, esto también podría ser causa del DD.
Cuánto tienes asignado a la memoria virtual??? (el acceso depende del SO)